在企業管理實踐中，績效考核指標的建立方法主要有：依據組織結構和崗位職責來設計、依據管理流程和業務流程來設計、依據平衡計分卡來設計等三種方法。
（1）依據組織結構和崗位職責來設計
依據組織結構和崗位職責建立關鍵業績指標體系，部門的關鍵業績考核指標根據部門職責來進行分解設計，崗位關鍵業績指標根據崗位職責來進行分解設計。這種方法的優點是設計過程簡單，好操作；但缺點是不能很好地體現關鍵業績指標思想，因為崗位職責太多，設計重點往往放在常規例行工作上，而對非常規重要工作可能會忽視。
（2）依據管理流程和業務流程來設計
通過分析核心管理流程和業務流程，提煉關鍵業績指標。這種設計方法的特點是能很好地體現關鍵業績指標思想，結果指標和過程指標均能得到很好的體現；但這種方法經常會被發現有些指標找不到責任人的情況，因為很多流程是跨部門運作的，如果流程關鍵控制點正好是兩個部門的接口部分，那么就容易引起扯皮現象。
（3）依據平衡計分卡來設計
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