流水線生產方式的不完美，它至少存在以下不完美的地方：

　　第一，為了追求分工專業化的效率，它往往被分解成很多的工序，相應地需要較多的作業者，而且這些作業者從事的是較枯燥的、簡單的、重復性的工作。有人指責亨利·福特的流水線式生產侮辱了原先生產者作為“手藝人”的榮譽。人是有思維能力的，流水線上的作業者也會有自己的想法，并經常把這些想法帶到工作中，以至于亨利·福特本人為此曾感慨：“我只需要每個人的一雙手，可是他們卻把腦袋也帶來了。”

　　第二，為了實現流水線的順暢運轉，需要進行生產線平衡，也就是生產線流動要保持一定的“節拍”，這個節拍由傳送帶的移動速度控制。而為了達到總體的協調和效率，在局部必須有效率的損失，也就是“平衡率”幾乎不可能得到1，流水線平衡率與1的差距就是流水線的效率損失。

　　第三，為了使作業者能夠在傳送帶邊上的作業臺排開以實現流水作業，流水線生產通常要求較大的面積。

　　而最大的問題是，為了得到最高的生產效率，流水線必須盡可能地保持一直運轉。可以極端化地想象一下，還是上面那個例子，一個不分工時需要30分鐘的工作，通過流水線生產可以縮短到21分鐘完成，但是需要7個人同時作業。如果只生產1件產品的話，那么需要的工作量就是21×7＝147人·分鐘，遠遠超出原來30人·分鐘。對于流水線式生產來說，生產的批量越大，流水線越是正常運轉，效率的優勢就越明顯，反過來，如果生產的批量較小，則效率優勢不明顯，乃至喪失。因為每一次產品的變更，都需要重新的工作研究以及生產的重新安排，并需要相應的培訓。盡管培訓可能比較簡單，但是要得到好的生產線安排，工作研究工作要細致，才能使得生產線的平衡率較高。所以，流水線生產方式最適合的大規模生產的情況，福特將它的這種優勢發揮到了極致，而決定只生產一種車型——T型車，流水線的效率就可以達到最高。

　　而為了保持流水線的效率，它不能輕易停工，即使在生產中發現了諸如質量方面的一些問題。有了質量問題，就標記出來等待產品到了流水線的末端進行返修。因此，福特流水線的末端有很大的場地供返修車停放。而很多時候，質量問題不是個別的，而是系統性的，因此，到生產線末端再返修可能會遇到很多同樣原因造成的質量問題，導致巨大的浪費，這是效率的巨大損失。