施祖麟，1947年出生，江蘇蘇州人。1970年在清華大學水利工程系畢業后留校任教。1982年獲工學碩士學位。先后在美國加州大學戴維斯分校經濟系訪問和合作研究。
1991年至1996年任清華大學核研院能源研究室副研究員。1996年10月開始在清華大學21世紀發展研究院任副研究員、研究員，同時任綜合研究部主任、清華大學《發展研究通訊》主編之一。現任清華大學公共管理學院 / 21世紀發展研究院研究員，博士生導師；
同時任院學位分委員會副主席，區域與城市發展研究中心主任。
中國致公黨第十二屆中央委員、致公黨北京市委第六屆委員會副主任委員。