在傳統的管理哲學里，管理中的行為方式是“兩者擇一”：要嘛是，要嘛不是；或做，或不做。居中是不可理解的。但依照本元管理哲學，卻不認為“真理在兩者之一”。反而是“允執其中”，奉行中道。就是：“真理不在二者之一，卻存在于二者之間”。處理事務力求“無過無不及”，以適度為佳，管理力求合理。不求一個戰勝另一個，力求通過中介獲得和諧、統一。

比如，在企業利益和員工利益之間，就不是兩者擇一，為企業的盈利而無視員工利益。而是通過“職位”把兩者聯系起來，使企業員工化，員工企業化，把共性和個性一致起來，達到兩者的和諧一致。

在同業之間，也不再是零和游戲,兩者必擇一，或者戰勝它，或者敗給它。而是通過策略聯盟、共生等方式，力求二者之間的和諧統一。

現代公司也不僅僅是股東控制下的賺錢機器了，它正在逐漸成為內部員工與股東共同生存的生態系統。總之，本元管理的哲學基礎是宇宙平衡與循環的哲學，社會, 社群, 個體平衡與循環的整體哲學。