《黃帝內經》是早期中國醫學的理論典籍。世簡稱之為《內經》。最早著錄于劉歆《七略》及班固《漢書·藝文志》，原為18卷。醫圣張仲景"撰用素問、九卷、八十一難……為傷寒雜病論"，晉皇甫謐撰《針灸甲乙經》時，稱"今有針經九卷、素問九卷，二九十八卷，即內經也"，《九卷》在唐王冰時稱之為《靈樞》。至宋，史嵩獻家藏《靈樞經》并予刊行。
由此可知，《九卷》、《針經》、《靈樞》實則一書而多名。宋之后，《素問》、《靈樞》始成為《黃帝內經》組成的兩大部分。
《內經》冠以黃帝名，并非真為黃帝之作。淮南子曾指出：
世俗之人，多尊古而賤今。故為道者，必讬之于神農、黃帝。
《內經》既非黃帝之作早已為確論，但其成書究竟何時？又出于何人之手？對此，歷代以來意見紛紜，終未能取得共識。例如，司馬光指出：謂《素問》為真黃帝之書，則恐未可。他認為"此周漢之間，醫者依讬以取重耳"。綜觀歷代學者，在《內經》之成書時代上，約有以下幾種觀點，如有成書于戰國者，有成書于戰國末至秦漢之際者，有成書于西漢者，或謂更為晚出者等等，現仍為學者爭論最為激烈之問題之一。在這個爭論之中，有一點則為大家所公認，即明代醫學家呂復之所論："乃觀其旨意，殆非一時之言。其所撰述，亦非一人之手。"
《漢書·藝文志》有《黃帝內經》、《黃帝外經》，還有扁鵲內、外經等。何以分內經、外經，猶《易》之有內、外卦，《春秋》之有內、外傳，《莊子》之有內、外篇，《韓非子》之有內、外儲說。故知醫學之分黃帝內經、外經等，只有次第名而并非有何深意。今《黃帝外經》早佚，唯《黃帝內經》尚存。
《黃帝內經》成書后，在其傳抄流布過程中，既有內容的散落，也有摻入和補撰，在歷代注釋整理中，也增加了該書內容。因此，出現了何為原文？何為訛傳？何為雜入等難以分辨的混亂局面，為研究者的辨析鑒別造成了困難，也時有爭論。《黃帝內經》流傳甚廣，現就今之《素問》、《靈樞》分述之。
《素問》：公元6世紀，全元起首次全面注釋，當時第七卷早佚，故只有8卷。公元762年，王冰次注，稱為《黃帝內經素問》24卷，81篇，其中除72-73篇有目缺文外，經王氏補入"舊藏"7篇。11世紀，北宋校正醫書局對王氏注本再加校勘注釋，改名《重廣補注黃帝內經素問》，成為宋之后歷代刊刻研究之藍本和依據，刊刻者有數10種之多。
《靈樞》：在《漢書·藝文志》名為《九卷》，公元6世紀前后，其名有《針經》、《九墟》、《九靈》、《靈樞》等不同書名之傳本。南北朝、隋唐間，《針經》注本多種曾有流傳，并見于隋唐及日、朝之醫事法令將其列為醫學教材，但未能流傳后世。如前所述，宋史類刻刊《靈樞》（1135年）后，即成為《九卷》之唯一刻本流傳于世，雖有12卷本與24卷本之不同，但篇目內容次第等并無差異。
《素問》、《靈樞》歷代之注釋、節要、語譯以及國外之注釋、譯本，共計有200余種之多，其中少數影響大者，每種刊刻印行有達40多次者。
《黃帝內經》內容十分豐富，《素問》偏重人體生理、病理、疾病治療原則原理，以及人與自然等等基本理論；《靈樞》則偏重于人體解剖、臟腑經絡、腧穴針灸等等。二者之共同點均系有關問題的理論論述，并不涉及或基本上不涉及疾病治療的具體方藥與技術。因此，它成為中國醫學發展的理論源藪，是歷代醫學家論述疾病與健康的理論依據，盡管醫學家學說各異而有爭論但鮮有背離之者，幾乎無不求之于《內經》而為立論之準繩。這就是現代人學習研究中醫，也必須首先攻讀《內經》的原故。因為，若不基本掌握《內經》之要旨，將對中醫學之各個臨床科疾病之認識、診斷、治療原則、選藥處方等等，無從理解和實施。
《黃帝內經》的科學成就：前已提及，《內經》之成書，既非成于一時，也非成于一人。由此可知，乃是先秦諸多醫學家對其前代醫學發展的一次系統的總結，是對十分豐富的醫療經驗的高度概括，并從而奠定了中醫學發展的理論基礎，達到了歷史的高水平，有著許許多多的科學成就和十分正確的預見。或者正因為如此，《內經》至今仍有其很強的生命力。
現僅就其科學成就之重要者分述如下：
公然宣布與巫術決裂。中國醫學在商周時期仍處于鬼神觀念占居統治地位，不但病因要尋求鬼神作用的因素，治療也多巫術之法。到春秋戰國時期，這種認識逐漸發生了動搖，圍繞著疾病診療是否鬼神因素在理論和實踐上展開了激烈的爭論。民間醫生扁鵲及《內經》作者們在這場影響深遠的斗爭中，鮮明地反對鬼神說。《史記·扁鵲侖公傳》明確記述了扁鵲行醫的六不治，其中之一即"信巫不信醫不治"。《內經》的作者在《素問·五臟別論》中強調："拘于鬼神者，不可與言至德；惡于針石者，不可與言至巧。"用意深刻地闡明了他們在這關系醫學發展道路和方向上的立場和觀點，他們的觀點為歷代醫學家所遵循，從而保證了中國醫學基本上一直沿著唯物的疾病觀不斷發展。
人體解剖、生理研究的成就。認識人類疾病必須首先認識人類自身。《內經》的作者們很可能直接參與了對人體的解剖研究，并實地進行了人體體表與內臟的解剖。《靈樞·經水》："若夫八尺之士，皮肉在此，外可度量切循而得之，其死可解剖而視之。其藏之堅脆，腑之大小，谷之多少，脈之長短，血之清濁……皆有大數"。例如消化道解剖，《靈樞》已詳述了唇口幾何，唇到齒距離幾何，舌形重量，齒至咽距離，會厭形質，口腔容量，食管長度，胃容量及體大小，賁門、幽門形質，小腸長度、如何曲屈、容量，大腸之升、橫、降、容量、重量，***形質等等，其所記述之大小、長度、容量、形態與相互關系等，同現代人體解剖基本一致。又如關于消化系統之功能，血液環流周身之功能，泌尿生殖系統之功能，雖然認識多有失之于籠統，然而也有許多科學的論斷。譬如血與脈的關系，不但對血管區分為經脈（大血管）、絡脈（大血管之分支血管）和孫脈（細小血管），并且明確指出血脈是運行人體經過飲食消化而產生營養精氣等物質的，特別強調這種運行在人體"如環無端"，周而復始，永無休止。實際上他們對人體的血液循環系統提出了科學的預見。
高明的醫療技術。《內經》是一部理論專著，但個別部分也涉及醫療技術。例如該書不但記述了水浴療法、灌腸技術，而且比較正確地論述了血栓閉塞性脈管炎——脫疽的外科手術截趾術等。《內經》已設計使用了筒針（中空的針）進行穿刺放腹水的醫療技術，這是一次改善腹水治療和減輕患者痛苦比較成功的嘗試。筒針穿刺放腹水雖然未能創造出根治腹水的方法，但作為一種醫療技術在后世繼續得到發展和應用。
至今雖然在器械條件和技術上已有了極大的進步，然而其原理卻是完全一致的。可貴的是《內經》還記述了筒針的制作技術要求，指出："故為之治針，必筒其身而鋒其末"。在進針的技術要領方面也已達到與現代基本相似的步驟和方法。
提倡疾病預防強調早期治療。中國醫學自古就十分重視促進人體健康以預防疾病的思想，追其原則始于《內經》。例如：反復強調的"虛邪賊風（指致病因素），避之有時"。又如強調，一位高明的醫學家，應當治未病之病，而不是治療已病的病。如果等到病已發而后才給予藥物治療，就猶如渴而穿井，戰亂已成才去制造兵器的道理一樣，不是太晚了嗎？
又說：一位高明的醫學家，治療疾病必須"救其萌芽"。并批評了醫學家中對一些久病輕易作出"不可治"的結論，指出：
"疾雖久，猶可畢也（是可以治愈的），言不可治者，未得其本也。"其思想都是很先進的。
《內經》雖有不少待研究、商議的內容，但其科學的內容、積極探求的思想等，是其2000多年來富有旺盛的生命力的源泉。
《內經》不單在中國醫學的發展上創造了2000多年醫學家們不斷研究、不斷運用以解決醫療理論和技術的有效記錄，而且為朝鮮、日本以及東南亞醫學家所研究和運用，以為指導，也有千余年的歷史。同時，《內經》也早已為歐美漢學家、私人收藏家、國家圖書館所廣泛收藏和流傳，而且有被部分節譯或全譯為英、法、德等文本出版者。在當代科學日新月異發展的今天，《內經》也更加為人類所重視。
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