開設網店
淘寶賣家主要為中小型企業，淘寶不賣任何東西，在淘寶上的賣家主要分為兩類：賣能夠在眾多商品中脫穎而出的特色商品或特賣特價商品。在淘寶開設網店不需要實名制，但需要綁定銀行卡，一名會員只能開設一個店鋪，店鋪無法轉讓，但可司法繼承。除了實體商品外，淘寶上還可以售賣虛擬物品和一些特別的服務，例如微博粉絲，幾乎什么都能賣，但對部分危險物品仍有限制，2014年3月，淘寶刪除了部分危險刀具，西瓜刀、長刀、斬馬刀等不能正常搜索展示，4月1日，在淘寶購買危險性刀具必須實名認證。然而自2016年4月起，具有強烈刺激性氣味且內部氣壓較大的瑞典鹽腌鯡魚也在淘寶售賣。
淘寶允許賣家使用淘寶提供的計算機和網絡技術設計個性化店鋪“旺鋪”，也可以和企業自己的網站進行對接，如果企業沒有能力自己創建網站，淘寶可以為其創建，但在網站首頁上會有“Power by Taobao”這一標語。淘寶網發布的《網購市場發展報告》顯示，淘寶賣家44%每月收入1000-2000元，16%的賣家月收入在1000元左右。在淘寶平臺就業者中，28.1%在淘寶上獲得的收入高于當地最低工資水平，47.8%將淘寶作為唯一收入來源。據調查，5年以上的網店平均雇傭員工為3.4人。2011年5月24日，淘寶開放“我的淘寶（i.taobao.com）”為淘寶的第三方插件平臺，淘江湖融入“我的淘寶”之中，不再作為獨立的應用，網址跳轉至“我的淘寶”，同時新增了管理客戶功能。
商家與顧客交流淘寶網的即時聊天工具是阿里旺旺，該軟件可以實時的保存雙方的聊天記錄，淘寶網支持阿里旺旺的聊天記錄可以作為交易出現糾紛時的證據使用。2013年1月29日，淘寶網推出千牛用以替代阿里旺旺賣家版，千牛是專為淘寶網賣家提供的集各種輔助交易插件聊天應用。為了對付騰訊微信，淘寶還推出了微淘，通過微淘創建商家與用戶之間的粉絲關系。
交易付款
淘寶網上線之初的大部分的交易都是同城進行，即“一手交錢，一手交貨”，也有一些交易采取銀行間轉賬的方式。而為了降低用戶上當受騙的風險，淘寶網鼓勵“線上下單，線下成交”的方式，但這一交易方式有很大的局限性。為了解決用戶間的資金安全，并在買家和賣家之間創建互相信任的關系，淘寶團隊開發出支付工具支付寶，當前為淘寶交易中使用最普遍的支付應用，買家需要先將錢轉賬給支付寶來給支付寶充值，在淘寶購買商品時付款后錢款會由支付寶凍結扣留，不會立刻支付給賣家，等待賣家貨物運達后買家驗貨并確認收貨后才會將錢款打入賣家賬戶。在淘寶上轉賬不需要手續費，因此有父母將生活費通過淘寶交易轉給孩子。由于是網絡購物，所以不會開具發票。
售后評價
淘寶網倡導“以買賣雙方互評為基礎的誠信機制”，信用評級分為“好評”、“中評”、“差評”三種類型。另外買家還可以對物流公司、賣家發貨速度、商品與賣家描述相符程度三項指標進行1—5星級的不記名評價，買家可以選擇不做評價、做出全部評價或部分評價，賣家獲得的評分將在網上店鋪中顯示，此評分會影響賣家出售的商品在搜索列表中的排序。但這一機制會被反向利用，并形成了炒信黑色產業鏈。中國政法大學知識產權研究中心研究員張樊表示：“如果賣家在信用上作弊，就有違反《消費者權益保護法》，欺詐消費者的嫌疑。”
虛擬、成人和茶葉這三個類目商品的評價是強制顯示匿名評價。
消費者保障運送中最容易受損的商品為圖書和牛奶。據報道，只要是實名的舉報和投訴，淘寶都會受理。賣家會作出一些保障承諾。如果發生交易糾紛，雙方可提交快遞單復印件和商品照片等交易證明，由淘寶網仲裁是否將錢款打入賣家賬戶或者退還給買家。由于是快遞送貨，所以需要填寫收貨地址，如果發生糾紛，買家可能會收到對方寄來的刀片、靈位或者冥幣。
假冒偽劣商品
2010年2月，淘寶投入1億并承諾如果買家買到假貨淘寶網會先行賠付，3月8日，淘寶網發起創建的消費者維權平臺上線。2010年淘寶共處理侵權商品1400萬件，處罰不同程度侵權行為的會員59萬次。2011年2月28日，因假貨和盜版盛行，美國貿易代表辦公室（USTR）將淘寶和百度列入“惡名市場”。2011年4月21日，中國官方下發了《關于進一步推進網絡購物領域打擊侵犯知識產權和制售假冒偽劣商品行動的通知》，明確了淘寶等網購平臺的責任：要承擔市場主辦方責任，要“采取技術手段屏蔽侵犯知識產權和制售假冒偽劣商品信息，創建24小時網上巡查制度，及時處理違法違規行為”。焦點訪談稱其知假售假。2011年上半年，淘寶網創建了商品抽檢制度，并處理侵犯知識產權商品信息4700萬條，處罰賣家24萬余人次，接受投訴處理的商品信息為157萬余件。淘寶有2000多名員工處理消費者維權，占公司員工總數的一半，淘寶還曾在一個星期關閉了18000多家售假店。為從“惡名市場”脫身，淘寶網刪除了8200萬件商品，貨值1800億元。2012年12月，淘寶網從“惡名市場”名單中除名。
2014年8月到10月，中國國家工商行政管理總局對網上所銷售的商品進行了抽查并于2015年1月23日公布了結果，結果顯示淘寶網的合格率僅為37.25%。2015年1月27日，淘寶網官方微博發布《一個80后淘寶網運營小二心聲——劉紅亮司長：您違規了，別吹黑哨！》一文回應工商總局的監測結果，稱“抽檢程序違規”。1月27日晚，國家工商總局新聞發言人表示“抽檢合法合規”，1月28日，國家工商總局公開了2014年《關于對阿里巴巴集團進行行政指導工作情況的白皮書》，指出阿里系網絡交易平臺存在的五大突出問題，包括主體準入把關不嚴、對商品信息審查不力、銷售行為管理混亂、信用評價存有缺陷、內部工作人員管控不嚴。隨后淘寶官方微博發表官方聲明認為劉紅亮司長在監管過程中存在程序失當、情緒執法的行為，用錯誤的方式得到一個不客觀的結論，對淘寶以及中國電子商務從業者造成了非常嚴重的負面影響，并決定向國家工商總局投訴。
2016年10月，對淘寶假貨問題不滿的美國服裝和鞋類協會申請將淘寶網重新列入美國貿易代表辦公室的“惡名市場”名單。同年12月，美國貿易代表辦公室發布2016年惡名市場名單，淘寶網時隔4年再度上榜。為此，阿里巴巴集團表示“非常失望”，稱美國貿易代表辦公室的決定忽略了阿里巴巴為打擊假貨所做的切實工作。中華人民共和國外交部發言人華春瑩也就該事件表示：希望雙方通過友好協商妥善處理雙方經貿關系中出現的問題，為彼此企業開展正常互利合作提供公平公正的環境。
2018年1月，淘寶網再度登上美國貿易代表辦公室年度“惡名市場”黑名單。對此阿里巴巴集團發表聲明表示“基于貿易保護主義抬頭，阿里巴巴再次成為美國貿易代表辦公室高度政治化環境下的犧牲品。美國貿易代表辦公室的惡名市場名單僅僅針對非美國國家，它已不是關乎知識產權保護，而是實現美國政府貿易政策目標的工具，其真實意圖終將為人所知。”
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